树状多肽的合成主要有两种方法,分别是传统的逐步固相合成法和化学选择及正交连接法(chemoselective and orthogonal ligation)。这两种方法分别对应于树枝状大分子合成的

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肽库是大量某一长度(如六肽)的短肽的集合，它包括了该长度的短肽的各种可能序列或其中的尽大部分，是近几年发展起来的一种技术。肽库的构建有两种途径：一种是有机合成法，一种是基因工程法。

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人工合成寡核甘酸片段，通过PCR拼接的方法，获得所需要的基因片段或者启动子等功能元件片段。

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所谓组合化学技术广义来说是将基本小分子作为作构造砖块，通过合成程序将砖块系统地装配成不同组合，分子具有多样性的建筑群即建立化学物质库

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自然来源或者重组表达的蛋白质经过一些粗提的步骤（例如：匀浆、离心、硫酸铵沉淀等）成为稳定的可以用于色谱分离的样品。

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